Ernst Hammerschlag war zunächst Internist und hielt als solcher in den 1930er Jahren sechs thematisch einschlägige Vorträge vor der Gesellschaft der Ärzte in Wien.
Nach dem "Anschluss" gelang ihm die Flucht in die USA. An der New York School of Psychiatry begann er Psychiatrie zu studieren, woraufhin er am Mount Sinai und Lenox Hill Hospital tätig war. Danach fungierte er als außerordentlicher Professor an der New York School of Psychiatry. In New York gehörte er bald zu den bekanntesten und prominentesten Vertretern der Fachrichtungen Psychiatrie und Psychotherapie. Hammerschlag starb am 29. Oktober 1973 in New York.